Здание
Здание музея построено во внушительном неоклассическом стиле, который был очень популярен в Европе в то время и находится в полном соответствии с классическими экспонатами стиля, которые размещены в здании музея. Начальный план был задуман архитектором Людвигом Ланге (Ludwig Lange), и он был позже изменен Панагисом Калкосом (Panages Kalkos), который был главным архитектором, Гармодиосом Влахосом (Harmodios Vlachos) и Эрнстом Циллером (Ernst Ziller). Впереди музея располагается большой неоклассический сад, который украшен скульптурами.
Расширения и реконструкции
Здание подверглось многим расширениям. Самым важным было строительство нового восточного крыла в начале 20-ого столетия, основанного на планах Анастасиоса Метаксаса (Anastasios Metaxas) и монтаж двухэтажного здания, разработанного Джорджем Номикосом, в 1932-1939 годах. Эти расширения были необходимы, чтобы приспособить быстро расширяющуюся коллекцию экспонатов. Новое восстановление музея заняло больше чем 1.5 года, чтобы закончить, во время которого музей оставался полностью закрытым. Музей вновь открылся в июле 2004 года, как раз к Афинским Олимпийским Играм, что включало эстетическую и техническую модернизацию здания, установку современной системы кондиционирования, реорганизацию коллекции музея и ремонта повреждений, которые были нанесены зданию землетрясением 1999 года. Комнаты с Минойскими фресками открылись для общественности в 2005 году. К маю 2008 года Министр Культуры Михалис Лиапис (Mihalis Liapis) открыл очень ожидаемую коллекцию египетской старины и коллекцию Элени и Антониса Стафатоса (Eleni и Antonis Stathatos). Сегодня, есть возобновленное обсуждение относительно потребности в дальнейшем расширении музея к смежным областям. Новый план был выдвинут для подземного расширения музея впереди.